mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTGTTGAAAATCGTTTGCAC AAATTTTGCACACATT TGTAGGGTCGGAAATTTTGCACACATTTACAATAATTGTAAATGTGTTGAAAATCGTTTGCACGACTGTGA 3 4 3' arm Drosophila_simulans mirbase mir-287 5e-27 dse-mir-287 7e-35 -19.5 ..((.(((((((((((((..(((((((((((.....)))))))))))...)))..)))).).))))).)). (-19.50)