mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATTGTACTTCATCAGTGCTCTG GCACATGCTGAAGTACACTCA CATGTCTATTGTACTTCATCAGTGCTCTGGTGTGTCTCGTAACCCGGCACATGCTGAAGTACACTCAATATG 4 1 5' arm Drosophila_simulans mirbase mir-305 7e-23 dme-mir-305 7e-29 -23.8 (((((..(.(((((((((.(((((((..((.((........))))))))).)).))))))))).)..))))) (-23.80)