mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATTGCACACTTCCCGGCCTTT AGGACGGGTCGTGTGTCAGTATA AACATAAACATTTGCAGGACGGGTCGTGTGTCAGTATATTTACTTCTTAGCTATATTGCACACTTCCCGGCCTTTAAATGTCCAATGTT 4 1 3' arm Drosophila_simulans mirbase 100 dse-mir-310 1e-40 -33 (((((..(((((((.(((.((((..(((((.(((((((.(((.....))).))))))))))))..)))).))).)))))))...))))) (-33.00)