mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATTCGAGCCAATAAGTTCGG GTAACTTGTGTGGCTTCGAATGTACC TCGTAACTTGTGTGGCTTCGAATGTACCTAGTTGAGGAAAAGTCCCGTGTCGGATTTTGTTACCTCTGGTATTCGAGCCAATAAGTTCGG 1 5 3' arm Drosophila_simulans mirbase mir-314 4e-28 dse-mir-314 4e-46 -34 .((.(((((((.(((((.(((..(((((.....((((.(((((((......)))))))....)))).)))))))))))))))))))))). (-34.00)