mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAATTGACTCTAGTAGGGAGTC CTCCCTAACGGAGTCAGATTGA CCCTGGCATGGCGCAACCAGTCCTGGTGAAGCTCAAATTGACTCTAGTAGGGAGTCCTTTAATGAGCGACTCCCTAACGGAGTCAGATTGAGCTACAAAGGAGCGAGACAACAGAGGA 3 0 5' arm Drosophila_simulans mirbase mir-929 6e-40 dme-mir-929 6e-40 -56.3 (((((......(((......((((..((.(((((((.((((((((..((((((((((((....))).)))))))))..)))))))).))))))).)).)))))))......))).)). (-56.30)