mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAACCGTCCAAAACTGAGGC CTTAATTTTCGACGTGTTTTGGT GTAGTGTTGTCCACAATAGACCTTAATTTTCGACGTGTTTTGGTGTGCTGGGGAGTTCTATTCCGATTGAAACCGTCCAAAACTGAGGCCAACTGTGAGGCGTGAGCATCTATC 5 1 3' arm Drosophila_simulans mirbase 100 dme-mir-957 1e-46 -30.2 (((((((((((((((...(.(((((.((((.((((.((((..((......((((......)))).))..)))))))).)))).))))).)...)))).))))...))).)))). (-30.20)