mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGTCATCGGGGGTATTATGAA TTAGTACTCGGGTTGATAAAG CTTTGTTCTATATTCTTAGTACTCGGGTTGATAAAGACCTTTTCTTTGCGGAGCCTTTGTCATCGGGGGTATTATGAAATATAGTTTAAAGA 5 0 3' arm Drosophila_simulans mirbase 100 dme-mir-959 4e-40 -26.6 (((((..((((((((.((((((((..(.((((((((..((((.......)))).)))))))).)..)))))))).).)))))))..))))). (-26.60)