mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGATCATCAGTAAGTGAGAT TTCGTTTTCTGGCAATCAAAGG TGTGCTCGTTATCATGGGCCGAGTTACCTTTGATCATCAGTAAGTGAGATTGTTTCTGATACGATTTCGTTTTCTGGCAATCAAAGGAACTCGACTCGACTTGAATCTACA 3 0 5' arm Drosophila_simulans mirbase 100 dme-mir-961 4e-28 -36.8 .(((....(((...((((.((((((.((((((((..((((.((((((((((((.......)))))))))))).))))..)))))))))))))).))))...)))...))). (-36.80)