mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACAAGGTAAATATCAGGTTGTTTC AACATCTGTATATACCTTTGAT TACTACTGATTTTCTTAGTCTAATCTAAAACAAGGTAAATATCAGGTTGTTTCCTGTATTAGATCGAAACATCTGTATATACCTTTGATCCGGTTGGACAAAAGTGCATCTTCTAGTG 3 2 5' arm Drosophila_simulans mirbase 100 dme-mir-963 3e-38 -28.1 (((((..(((...(((.((((((((......((((((.(((.(((((.(((((............))))))))))))).))))))......))))))))..)))...)))...))))) (-28.10)