mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTAGAATAGGGGAGCTTAACTT GTTAAAAGCCACTGTTCTAAGA TTGGTCCAACTTGCCTTAGAATAGGGGAGCTTAACTTGTGTTTTTAATGTTTAAGTTAAAAGCCACTGTTCTAAGACAATTTGATGATCAAA 4 0 5' arm Drosophila_simulans mirbase 100 dme-mir-964 7e-39 -28.82 (((((((((.(((.((((((((((.((...((((((((.............))))))))...)).)))))))))).))).)))..)))))). (-28.82)