mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAGTAGTATCCATTAAAGGGTTG ACCGTTTGATGTACTACTTTAG TTGTTCATGGAAGCTTCCTTAAGTAGTATCCATTAAAGGGTTGTTCTCAACATGCAAATCAACCGTTTGATGTACTACTTTAGGAATCTACAGTCAAA 2 2 5' arm Drosophila_simulans mirbase 100 dme-mir-968 1e-37 -29.69 (((....((..((.(((((.((((((((..(((((((.(((((................))))).))))))))))))))).))))).)).))..))). (-29.69)