mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AACTTGACACGTTGAGCTCGT GAGTTCCACTAAGCAAGTTTT GAATCCCCAAGTCTCTGTCCTACGTCCGAGTTCCACTAAGCAAGTTTTGAGATCGTTTTAAAAACAAAAACTTGACACGTTGAGCTCGTTCGTGGGATGGACTACTGCAATTC 6 0 3' arm Drosophila_simulans mirbase mir-969 4e-50 dme-mir-969 2e-48 -37.67 ((((.....(((.(((((((((((..(((((((.((....((((((((..................))))))))....)).)))))))..)))))))))))..)))...)))) (-37.67)