mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCATAAGACACACGCGGCTAT AGCTAGCGGGTGTTTTATTTGGTA GTGAACGTAATCGTAAGGCATCTGTTGCAGCTAGCGGGTGTTTTATTTGGTAGCTGAATTGATTTGAATCTATCATAAGACACACGCGGCTATAACCGATGTCTAAATGCTTCA 2 3 3' arm Drosophila_simulans mirbase 100 dme-mir-970 5e-40 -35 .((((.(((....(.(((((((.((((.((((.(((.((((((((..((((((.(..(......)..).)))))))))))))).))))))).)))).))))))).).))))))) (-35.00)