mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGATTAGTTATCATCAATGC ATTGGTGAGGACATCTCCAATG CGCATGCAGTGTCGTGGCATTGGTGAGGACATCTCCAATGGATTGGTTCTCATCATTGGATTAGTTATCATCAATGCCGGTGCACTGCACTGC 4 0 3' arm Drosophila_simulans mirbase 100 dme-mir-976 6e-33 -45.3 .(((((((((((..((((((((((((.(((...((((((((..((.....))))))))))...))).))))))))))))..)))))))).))) (-45.30)