mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGATATTCACGTTGTCTAA AGATAACTCGAATATCACATT AGTGCCGAAAATGCATCCCAAGGTATGGTTTAGATAACTCGAATATCACATTTTCAGTGTTCGATATCTGATGAGATATTCACGTTGTCTAAACCATGGTTTGTTTTTGAAAACT 3 0 3' arm Drosophila_simulans mirbase 100 dme-mir-977 1e-31 -36 .((((.......))))..((((.(((((((((((((((..(((((((.((...((((..........)))))).)))))))..))))))))))))))).))))............ (-36.00)