mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AACTACACGATATTCGTTCTTG AGAACAAATATCATGTAAATTGA AGTTAAAAAACAAAATCATGCTAGATCAAGAACAAATATCATGTAAATTGATTTTTTAAATCAACTACACGATATTCGTTCTTGAGCTTAATGGTTCTAGAGCT 3 1 3' arm Drosophila_simulans mirbase 100 dsi-mir-982a 0.0000000000003 -27.5 .............((((((...((.((((((((.((((((.((((..((((((.....)))))).)))).)))))).)))))))).))..))))))........ (-27.50)