mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTATTGTTATTTGTCCTTGAAC TCTTGGACAAATATCAAGTAGAT AGTTAAAAAACGAAATCATGCGAGATCTTGGACAAATATCAAGTAGATTATTATTATACATCAATTTATTGTTATTTGTCCTTGAACTTAATTGTTTTACAGCTG 6 1 3' arm Drosophila_simulans mirbase 100 dme-mir-982 0.000000001 -21.52 ((((..(((((((..((....))..((..(((((((((...((((((((.............))))))))..)))))))))..))......)))))))..)))). (-21.52)