mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCACCACATGATTCGGCTT GCCCGAATTATGTGGGAGCTGCG AGGAAGAAATGTCGTTCACCTGTACCCCGCAGCCCGAATTATGTGGGAGCTGCGCCGTTTCCAAAGTCCGTAGCACCACATGATTCGGCTTCGTGGTGCAGGATATCATCGGTTTTTGCT 2 2 3' arm Drosophila_simulans mirbase mir-995 7e-43 dme-mir-995 5e-34 -51.1 ((.(((((.((..(....((((((((.((.((((.(((((((((((..((((((.(.........)..)))))).))))))))))))))).)).))))))))....)..)).))))).)) (-51.10)