mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGGTAAACTCCCAAGGATCAGG CGATCCTTGGGTTTCTGCTCTCG GCCCGCGATGATGTAAGCTGGCCTGTCCCTGGGTAAACTCCCAAGGATCAGGTGGAGATTGAATCCCGATCCTTGGGTTTCTGCTCTCGGGCAAGGTCAGCAGTGCCCGCGAAGGGCC 6 0 5' arm Drosophila_simulans mirbase 100 dme-mir-1001 1e-43 -55.9 (((((((.....(((.((((((((((((..(((((....((((((((((.((............)).))))))))))....)))))..)))).))))))))..))).)))...)))). (-55.90)