mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATTGTATGTTGTATTTGCAGT GTGAGTATGGCTATACAAATCA GCAATAAGTTAGACGTGAGTATGGCTATACAAATCATCTGGAACATACGTTCTAATGCATGTATTGTATGTTGTATTTGCAGTTTTATGATAGCA 6 2 3' arm Drosophila_simulans mirbase 100 dme-mir-2489 7e-42 -24.3 ((.((.....(((((..((((..((.((((((..((((((((((....))))))..).)))..))))))))..))))..).))))....)).)). (-24.30)