mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATCACAGCCAGCTTTGATGAGC TCTCAAAGTGGTTGTGAAATG GCTGCGCTCTCAAAGTGGTTGTGAAATGCATTTGAAAGCTTTGCGCGCATATCACAGCCAGCTTTGATGAGCTTAGC 1 2 3' arm Drosophila_virilis mirbase mir-2 9e-35 dgr-mir-2a-1 5e-33 -35.1 ((((.(((((((((((((((((((.((((........((.....)))))).))))))))).)))))).)))).)))) (-35.10)