mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATCACAGTGGCTGTTCTTTTT AGAGAATAGACGCTGTGCTGTA AGTAGAGAGAATAGACGCTGTGCTGTATGTTTTGCGTATGGTCTATATCACAGTGGCTGTTCTTTTTGTA 4 0 3' arm Drosophila_virilis mirbase mir-6 5e-33 dgr-mir-6-1 2e-19 -26.31 ..((((((((((((.((((((((((((((.....))))))).......))))))).)))))))))))).. (-26.31)