mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGTATTACATCAGGTACTGGT CAGTACTTATGTCATACTACGC TACGGTTGAGTATTACATCAGGTACTGGTGTGCCATTTAACTAACAACCAGTACTTATGTCATACTACGCCGTG 3 1 5' arm Drosophila_virilis mirbase mir-12 5e-33 dgr-mir-12 3e-34 -29.4 ((((((..(((((.((((.((((((((((((............)).)))))))))))))).)))))..)))))) (-29.40)