mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGCAAGATGTCGGCATAGCTGA ATTTTTATAGCGCTATGCTGCATCTAGTCAGT TCTGTTGTTCAATTGGCAAGATGTCGGCATAGCTGACGTTTGAAAGCGCATTTTTATAGCGCTATGCTGCATCTAGTCAGTTATTCAATGGA 2 11 5' arm Drosophila_virilis mirbase mir-31 1e-43 dgr-mir-31a 2e-35 -34.7 (((((((...(((((((.(((((.(((((((((((.((((....))))))..........)))))))))))))).)))))))...))))))) (-34.70)