mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGGTGCATTGTAGTCGCATTG ATACAACTGCAGTGCAAGCTCC TGGAGCTGTTACGGAGGTGCATTGTAGTCGCATTGTCTGTCTCAAATTTGCCCGCGGCAATACAACTGCAGTGCAAGCTCCGTGCAGTTCAC 3 1 5' arm Drosophila_virilis mirbase mir-33 2e-33 dgr-mir-33 6e-30 -42.7 ..(((((((.((((((.(((((((((((.(.((((.((((..((....))...)))))))).).)))))))))))..))))))))))))).. (-42.70)