mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGATTGTCCAAACGCAATTCTTG AGGGTTGCGACTGGGCATCGCG TAATTCGATTTTTAGCTATGATTGTCCAAACGCAATTCTTGTTGATTTCAAATACTCAAGGGTTGCGACTGGGCATCGCGGCTCGAAATGAGAATCC 2 1 5' arm Drosophila_virilis mirbase mir-219 2e-33 dwi-mir-219 7e-42 -34.5 ..((((.(((((.(((..((((.(((((..((((((((((((((....))).....)))))))))))..)))))))))..))).)))))..)))).. (-34.50)