mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGGAACTTAATACCGTGCTCT AGCGAGGTATAGAGTTCCTACG ACCGAAGTCTATATACCATCAGCGAGGTATAGAGTTCCTACGTGCAAATTGCAATAATCGTAGGAACTTAATACCGTGCTCTTGGAGGGCTGTCGAC 4 0 3' arm Drosophila_virilis mirbase mir-276 2e-45 dmo-mir-276b 1e-46 -39.9 ..((((((((.....(((..((((.(((((.((((((((((((((.....))).....))))))))))).))))).))))..))).))))).))).. (-39.90)