mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACTAGATCCACACTCATTAA AGTGAGTGAGGGTCCAGTGTTTCACA GTACTACTGTTTTTAGTGAGTGAGGGTCCAGTGTTTCACATTCGTTTTTTCAAGTATTTGTGACTAGATCCACACTCATTAACAACGGTAGTTC 2 4 3' arm Drosophila_virilis mirbase mir-279 3e-47 dmo-mir-279 4e-34 -35.47 ..(((((((((.((((((((((.(((((.((....(((((..................))))))).))))).)))))))))).))))))))).. (-35.47)