mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAATCTCAATTTGTAAATGTGAG CACTTTGCAATTGGAGATTGCT GCAGCATTGATTAATCTCAATTTGTAAATGTGAGCGATTTTAAAGTATTTGACGCACTCACTTTGCAATTGGAGATTGCTCGAGATTGC 3 1 5' arm Drosophila_virilis mirbase mir-304 4e-37 dmo-mir-304 2e-38 -29 ((((..((((.(((((((...(((((((.(((((.(...((((.....))))..).))))))))))))...))))))).))))..)))) (-29.00)