mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCACTGGGTGAAGTTTGTCGTA TGGTAAACTTTGTTCAGTTTTG ATTATATGGTAAACTTTGTTCAGTTTTGCCAGGCTCTTTTTGTGCGCATCACTGGGTGAAGTTTGTCGTATAAT 6 0 3' arm Drosophila_virilis mirbase mir-3 2e-35 dmo-mir-309 7e-23 -28.8 ((((((((..((((((..((((((..(((...((.(.....).)))))..))))))..))))))..)))))))) (-28.80)