mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAACACAGCTGGTGGTATCCAGT TGGGATACACCCTGTGCTCGCT TGCAATTGCCGCTGGGATACACCCTGTGCTCGCTTTGAATTGTGCAAGCAAGTGAACACAGCTGGTGGTATCCAGTGGCCGTTGGC 4 2 3' arm Drosophila_virilis mirbase mir-317 2e-42 dwi-mir-317 8e-29 -37.8 ..((((.(((((((((...(((((((((.(((((......(((....)))))))).)))))..))))...))))))))).)))).. (-37.80)