mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATCACAGCCAGCTTTGATGAGC TCACAAAGTGGTTGTGAAATG GCTGAGCTCACAAAGTGGTTGTGAAATGCATTATTTGCTTTATCCAGCATATCACAGCCAGCTTTGATGAGCTCTGC 1 2 3' arm Drosophila_willistoni mirbase mir-2 9e-35 dpe-mir-2a-1 4e-18 -36.93 ((.(((((((((((((((((((((.((((.................)))).))))))))).))))).))))))).)) (-36.93)