mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGCAAGATGTCGGCATAGCTGA CGCTATGCTGCATCTAGTCAGT TCTGTTTTTCGAATTGGCAAGATGTCGGCATAGCTGATAATATTTTTAGAAAAGCGCTATGCTGCATCTAGTCAGTTTATTCAATAGA 4 1 5' arm Drosophila_willistoni mirbase mir-31 5e-40 dgr-mir-31a 0.00000002 -31.1 ((((((....((((((((.(((((.(((((((((.....................)))))))))))))).))))))))....)))))) (-31.10)