mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGTCCCCTTCAACCAGCTGT AGCTGGTTGACATCGGGTCAGAT TACAACACTGAATGTAGCTGGTTGACATCGGGTCAGATCTATTTATTTGAAGCATTTGGTCCCCTTCAACCAGCTGTAGCAGTGGTTGAT 6 1 3' arm Drosophila_willistoni mirbase mir-133 1e-43 dgr-mir-133 9e-32 -34.6 ..((((((((....(((((((((((....((..(((((((..........)).)))))..))...)))))))))))...)))).)))).. (-34.60)