mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAATGTAAAGAAGTATGGAG CCATGCTTCCTTGCATTCAATA CAGCCTTTGAGAGTTCCATGCTTCCTTGCATTCAATAGTATATACTCAAGCATATGGAATGTAAAGAAGTATGGAGCGAAATCTGGCGA 2 0 3' arm Drosophila_yakuba mirbase mir-1 6e-30 dse-mir-1 1e-40 -35 ..(((...((..((((((((((((.((((((((.(((((..........)).))).)))))))).))))))))))))....)).))).. (-35.00)