mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATCACAGTGGCTGTTCTTTTT AGGGAATAGTTGCTGTGCTGTA CGTAGAGGGAATAGTTGCTGTGCTGTAAGTTAATAACAAATATCTATATCACAGTGGCTGTTCTTTTTGTA 3 0 3' arm Drosophila_yakuba mirbase mir-6 2e-23 dme-mir-6-1 1e-24 -25.7 ..(((((((((((((..(((((.((((..(...........)..)))).)))))..))))))))))))).. (-25.70)