mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGTCCCCTTCAACCAGCTGT AGCTGGTTGACATCGGGTCAGAT TGCAACGCTGTGTGTAGCTGGTTGACATCGGGTCAGATCTGTTTTTCCAAGCATTTGGTCCCCTTCAACCAGCTGTAGCCAGTGGTTGAT 5 1 3' arm Drosophila_yakuba mirbase mir-133 1e-34 der-mir-133 6e-39 -36.1 ..((((((((..(((((((((((((....((..(((((((.........)).)))))..))...)))))))))))))..)))).)))).. (-36.10)