mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGTGGGACTTTCGTCCGTTT CCGGATGATGGTTCACAACGACC GTAATGGTACGGTGCGACCGGATGATGGTTCACAACGACCGTGTCCTTTAAACGGGTCGGTGGGACTTTCGTCCGTTTGTAACGCCATTTG 3 1 3' arm Drosophila_yakuba mirbase mir-278 1e-40 der-mir-278 1e-46 -37.2 ..((((((....(((((.(((((((.(((((.((.(((((.(((.......)))))))).))))))).))))))).)))))..)))))).. (-37.20)