mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACTAGATCCACACTCATTAA AGTGGGTGAGGGTCCAGTGCTTCACA ATACTACTGTTTTTAGTGGGTGAGGGTCCAGTGCTTCACATTGATTTTCTTAGTATTTGTGACTAGATCCACACTCATTAATAACGGTAGTTC 2 4 3' arm Drosophila_yakuba mirbase mir-279 2e-39 der-mir-279 4e-43 -36.4 ..(((((((((.((((((((((.(((((.((....(((((...(((.....)))...))))))).))))).)))))))))).))))))))).. (-36.40)