mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTATTTACGTTGCATATGAAATGATA TTATTTTATATGCAGGTATATGCAAC TGGCTTTTATGTATTTACGTTGCATATGAAATGATATTTATAGTAAACAGATTATTTTATATGCAGGTATATGCAACTTGAGGTCCT 2 1 5' arm Drosophila_yakuba mirbase mir-280 2e-36 dme-mir-280 2e-39 -26.3 .((((((..(((((.(((.((((((((((((((((.((((...))))...))))))))))))))))))).)))))....)))))).. (-26.30)