mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAATCTCAATTTGTAAATGTGAG CACTTTGCAATTGGAGATTGCT GCAGCATTGAATAATCTCAATTTGTAAATGTGAGCGGTTTGAGCCATTTGACGCACTCACTTTGCAATTGGAGATTGCTCGAGACTGC 3 1 5' arm Drosophila_yakuba mirbase mir-304 1e-31 der-mir-304 7e-45 -33.3 ((((..((((.(((((((...(((((((.(((((.((((.((....)).))).).))))))))))))...))))))).))))..)))) (-33.30)