mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATTGCACATTCCCCAGCCTGA GGCTGTGGATTGGGCTAGTACT AACAATTTTCGGCTGTGGATTGGGCTAGTACTGTGATTTTAGCATTAAGTATTGCACATTCCCCAGCCTGAAAGTGTTA 3 2 3' arm Drosophila_yakuba mirbase 100 der-mir-311b-1 5e-30 -27.5 ((((.((((((((((.(((.((.((.((((((.((((......)))))))))))).)).))).))))).))))))))). (-27.50)