mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTTGATTGTTGCTCAGAAAGC TTTCGAGCAATAATTGAAACC CACTTATATAATTTTGATTGTTGCTCAGAAAGCCCTTACTATTTAACAGCTGGCTTTCGAGCAATAATTGAAACCAGATAAGTG 2 1 5' arm Drosophila_yakuba mirbase mir-315 1e-31 dya-mir-315-2 2e-42 -32.43 (((((((....(((..((((((((((.(((((((.................)))))))))))))))))..)))....))))))) (-32.43)