mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGACAGAAGAGAGCGAGCAC GCTCGCTTCTCTTTCTGTCAACC ATAGTCGATTGGGCTTAGGCCCCGAAGAGATTGACAGAAGAGAGCGAGCACCTGGCGCGGCGACCGGCATGGAACGCATGCCCGCCCCGCCGCGTGCTCGCTTCTCTTTCTGTCAACCTCTCCCTCGTCCTGAGCCGACGCCGAT TCTAGCTTCTTGCCCAGCCCGGGTAGTACAATACAACCCCCGTCCCATCAGCTGGCAGAGGCCAGGCCATCAGCACCCACACCCACACCCACTCCCTCCGTTCCTCCTCCATCCTCCTGCCCCCAAGTACGGCCGCCGCCGCCCGCTCACCGGATCCAAGAAGAACAGCCGAGGGGTTCGGTCTCCCTCCCAGCAGTGACGAGCTAGCTGCTCCGTGCGTTGATTGCGTGTTTGTTATTACGTGTACGTCGTGTACCGGCCGTGTTTAGCTGCCACAAAATATAGTCGATTGGGCTTAGGCCCCGAAGAGATTGACAGAAGAGAGCGAGCACCTGGCGCGGCGACCGGCATGGAACGCATGCCCGCCCCGCCGCGTGCTCGCTTCTCTTTCTGTCAACCTCTCCCTCGTCCTGAGCCGACGCCGATCGAAGCGTCGT 0 2 5' arm Zea_mays mirnest mir-156 1e-29 zma-MIR156k 2e-58 -72.7 ...((((....((((((((...(((((((.(((((((((((((((((((((.(((((.((((...((((((.....)))))))))).))))).)))))))).)))).))))))))).))))...))).)))))))).....)))) (-72.7)