mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATCACAGCCAGCTTTGATGAGC CCATCAAAGCTGGTTTGTCATAGG GGAGACAAGAGAGCGAGTGGCATGCTTTTACCATCAAAGCTGGTTTGTCATAGGGCTTCGACTATCACAGCCAGCTTTGATGAGCAAAATTGTGTCCGGCAT 4 1 3' arm Nasonia_vitripennis mirbase mir-2 1e-28 ngi-mir-2 7e-39 -39.5 (((.(((((((((((.......)))))))..((((((((((((((.((.((((........)))).)))))))))))))))).......)))).)))..... (-39.50)