mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATCACAGCCATTTTGATGAG CATCAAATTGGTTGTGGAATG GAGCAGAGACATGGAACTTTTGCGGTCCGATACATCAAATTGGTTGTGGAATGTCTCGTCTTTCCATATCACAGCCATTTTGATGAGCTTGGCCCGTAGAACT 4 0 3' arm Nasonia_vitripennis mirbase mir-2 0.00000000000002 ngi-mir-13a 5e-43 -35.3 .................((((((((.((((..(((((((.(((((((((.(((...........))).))))))))).)))))))...)))).)))))))).. (-35.30)