mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACAGAAGAGAGTGAGCAC GCTCACTTCTCTCTCTGTCAGC GTGTTTGATTGTAGGGTGGAGGAGAGGTGAAAGCTGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGTGCCTTTCTTGCATGATGTATGATCGAGAGAGTTCATGCTCGAAGCTATGCGTGCTCACTTCTCTCTCTGTCAGCCATTAGAACTCCTCTATCTCTCAATCTCGC TAACGCGGGACCCAAATAAGCATAAATAGTAGTGGTTGATTGTGTAATTCCAGAGATATAAACGAATATCTCTAGAGATCTGCCTCATCAACAGCTGCAGTATTTGCTAGCCACATATATATATACACAGTTCCACACGTAGTTTATAACGGAAGAGAGAAGGAAAGAGAGAGGCAGAGTTTACTGCAACCATCAGTAGTTCTATGATTTTATTTTTACCGTTTTATTGCTGTTTCATGGTGTTTGATTGTAGGGTGGAGGAGAGGTGAAAGCTGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGTGCCTTTCTTGCATGATGTATGATCGAGAGAGTTCATGCTCGAAGCTATGCGTGCTCACTTCTCTCTCTGTCAGCCATTAGAACTCCTCTATCTCTCAATCTCGCTCTCTCTCGATCTATCTCAC 0 2 5' arm Zea_mays mirnest mir-156 1e-26 zma-MIR156c 1e-72 -69.7 (((...(((((..(((((((((((...(((..((((((((((((((((((((((.((((((....(((..((((((.......((....))..))))))..))))))))).)))))))).))))).)))))))))..)))...)))))))))))..))))).))) (-69.7)