mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCCTGAGACCCTAACTTGTGA ACAGGCTAGATTCTCTGGTAT ATAAAGCCTGCCGCCGCGTCGCCGGTTCCCTGAGACCCTAACTTGTGACGTCGCGTACGATATCTCACAGGCTAGATTCTCTGGTATTGGCGATGAGTGCTGCCTTTTGA 5 1 5' arm Nasonia_vitripennis mirbase lin-4 1e-25 nlo-mir-125 6e-52 -42.1 .........((.(((.((((((((((.((..((((..(((.(((((((.((((....))))...))))))).)))..)))).)).)))))))))).).)).))....... (-42.10)