mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGACGGAGAACTGATAAGGGC CCTTATCATTCTCCTGTCGAGT AACGTGCCTAAAGCCCCTTATCATTCTCCTGTCGAGTGTTAAAATTCTCTACGACTGGACGGAGAACTGATAAGGGCCCGAGGGTTACAGAT 2 2 3' arm Nasonia_vitripennis mirbase mir-184 3e-41 ngi-mir-184 2e-45 -34.3 ...((((((...(.(((((((((((((((.(((.(((((...........)).))).))))))))).))))))))).)...))).))).... (-34.30)