mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACTAGATCCACACTCATTAA AGTGAGTGATGGTCTGGTGCACG CCATCGGACAACGACCAGCCGATTGTACTGAGTGAGTGATGGTCTGGTGCACGGTTTATCGATCTGTGACTAGATCCACACTCATTAAGTACGTTCGGCT 1 3 3' arm Nasonia_vitripennis mirbase mir-279 2e-42 ame-mir-279 0.00000000002 -47.5 ...(((.....)))..((((((.((((((.((((((((.(((((((((.(((((.........))))))))))).))))))))))).)))))).)))))) (-47.50)